Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
H3f3aP84244 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H3f3aP84244 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms