Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubg1P83887 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubg1P83887 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms