Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

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Length 650 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sparcl1P70663 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sparcl1P70663 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sparcl1P70663 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sparcl1P70663 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sparcl1P70663 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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