Protein–RNA interactions for Protein: P70408

Cdh10, Cadherin-10, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh10P70408 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdh10P70408 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdh10P70408 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms