Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad50P70388 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad50P70388 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad50P70388 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad50P70388 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad50P70388 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rad50P70388 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad50P70388 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms