Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfi1P70338 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfi1P70338 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfi1P70338 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfi1P70338 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfi1P70338 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfi1P70338 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gfi1P70338 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gfi1P70338 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfi1P70338 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfi1P70338 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms