Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SbdsP70122 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SbdsP70122 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SbdsP70122 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SbdsP70122 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SbdsP70122 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SbdsP70122 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SbdsP70122 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms