Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hmgb1P63158 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmgb1P63158 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms