Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl30P62889 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms