Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbpl1P62340 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tbpl1P62340 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tbpl1P62340 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tbpl1P62340 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms