Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo4P61969 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms