Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vbp1P61759 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vbp1P61759 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms