Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf13P61216 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf13P61216 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf13P61216 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf13P61216 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf13P61216 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf13P61216 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf13P61216 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms