Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arf3P61205 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arf3P61205 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arf3P61205 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arf3P61205 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arf3P61205 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arf3P61205 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arf3P61205 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arf3P61205 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arf3P61205 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arf3P61205 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arf3P61205 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arf3P61205 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arf3P61205 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arf3P61205 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arf3P61205 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms