Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2kP61087 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms