Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Snap25P60879 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snap25P60879 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap25P60879 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap25P60879 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap25P60879 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snap25P60879 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snap25P60879 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snap25P60879 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snap25P60879 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snap25P60879 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snap25P60879 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snap25P60879 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms