Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CgnP59242 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CgnP59242 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CgnP59242 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CgnP59242 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CgnP59242 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CgnP59242 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CgnP59242 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CgnP59242 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CgnP59242 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CgnP59242 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CgnP59242 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CgnP59242 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CgnP59242 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CgnP59242 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CgnP59242 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CgnP59242 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CgnP59242 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CgnP59242 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CgnP59242 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CgnP59242 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CgnP59242 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CgnP59242 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CgnP59242 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CgnP59242 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CgnP59242 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CgnP59242 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CgnP59242 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CgnP59242 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CgnP59242 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CgnP59242 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CgnP59242 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CgnP59242 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CgnP59242 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CgnP59242 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CgnP59242 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CgnP59242 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CgnP59242 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CgnP59242 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CgnP59242 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CgnP59242 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CgnP59242 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CgnP59242 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CgnP59242 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CgnP59242 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CgnP59242 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CgnP59242 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CgnP59242 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CgnP59242 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CgnP59242 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CgnP59242 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CgnP59242 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CgnP59242 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CgnP59242 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CgnP59242 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CgnP59242 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CgnP59242 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CgnP59242 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CgnP59242 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CgnP59242 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CgnP59242 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CgnP59242 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CgnP59242 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CgnP59242 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CgnP59242 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CgnP59242 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CgnP59242 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CgnP59242 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CgnP59242 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CgnP59242 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CgnP59242 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CgnP59242 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CgnP59242 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CgnP59242 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CgnP59242 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CgnP59242 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CgnP59242 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CgnP59242 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CgnP59242 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CgnP59242 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CgnP59242 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CgnP59242 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CgnP59242 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CgnP59242 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CgnP59242 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CgnP59242 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CgnP59242 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CgnP59242 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CgnP59242 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CgnP59242 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CgnP59242 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CgnP59242 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CgnP59242 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CgnP59242 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CgnP59242 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CgnP59242 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CgnP59242 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CgnP59242 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CgnP59242 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CgnP59242 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms