Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdrg1P59048 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdrg1P59048 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
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