Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dpf3P58269 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dpf3P58269 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dpf3P58269 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dpf3P58269 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dpf3P58269 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dpf3P58269 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dpf3P58269 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dpf3P58269 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dpf3P58269 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dpf3P58269 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dpf3P58269 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dpf3P58269 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dpf3P58269 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dpf3P58269 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dpf3P58269 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dpf3P58269 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms