Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snrpa1P57784 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snrpa1P57784 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrpa1P57784 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms