Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp25P57080 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp25P57080 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp25P57080 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp25P57080 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp25P57080 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp25P57080 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp25P57080 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp25P57080 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp25P57080 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp25P57080 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp25P57080 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp25P57080 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms