Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TdgP56581 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TdgP56581 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TdgP56581 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TdgP56581 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TdgP56581 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TdgP56581 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TdgP56581 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TdgP56581 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TdgP56581 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TdgP56581 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TdgP56581 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TdgP56581 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TdgP56581 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TdgP56581 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TdgP56581 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TdgP56581 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TdgP56581 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TdgP56581 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TdgP56581 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TdgP56581 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TdgP56581 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TdgP56581 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TdgP56581 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TdgP56581 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TdgP56581 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TdgP56581 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TdgP56581 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TdgP56581 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TdgP56581 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TdgP56581 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TdgP56581 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TdgP56581 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TdgP56581 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TdgP56581 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TdgP56581 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TdgP56581 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TdgP56581 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TdgP56581 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TdgP56581 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TdgP56581 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TdgP56581 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TdgP56581 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TdgP56581 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TdgP56581 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TdgP56581 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TdgP56581 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TdgP56581 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TdgP56581 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TdgP56581 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TdgP56581 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TdgP56581 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TdgP56581 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TdgP56581 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TdgP56581 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TdgP56581 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TdgP56581 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TdgP56581 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TdgP56581 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TdgP56581 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TdgP56581 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TdgP56581 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TdgP56581 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TdgP56581 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TdgP56581 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TdgP56581 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TdgP56581 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TdgP56581 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TdgP56581 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TdgP56581 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TdgP56581 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TdgP56581 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TdgP56581 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TdgP56581 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TdgP56581 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TdgP56581 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TdgP56581 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TdgP56581 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TdgP56581 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TdgP56581 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TdgP56581 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TdgP56581 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TdgP56581 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TdgP56581 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TdgP56581 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TdgP56581 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TdgP56581 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TdgP56581 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TdgP56581 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TdgP56581 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TdgP56581 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TdgP56581 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TdgP56581 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TdgP56581 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TdgP56581 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TdgP56581 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TdgP56581 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TdgP56581 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TdgP56581 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TdgP56581 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms