Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gp1bbP56400 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gp1bbP56400 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms