Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acod1P54987 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acod1P54987 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acod1P54987 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acod1P54987 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acod1P54987 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acod1P54987 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acod1P54987 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acod1P54987 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms