Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Map3k1P53349 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Map3k1P53349 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Map3k1P53349 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms