Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2e3P52483 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2e3P52483 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms