Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e1P52482 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms