Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccr5P51682 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccr5P51682 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccr5P51682 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccr5P51682 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccr5P51682 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccr5P51682 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccr5P51682 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccr5P51682 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms