Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr4P51680 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms