Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RoraP51448 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
RoraP51448 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RoraP51448 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RoraP51448 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RoraP51448 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RoraP51448 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RoraP51448 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RoraP51448 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RoraP51448 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RoraP51448 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RoraP51448 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RoraP51448 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RoraP51448 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RoraP51448 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RoraP51448 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RoraP51448 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RoraP51448 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RoraP51448 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RoraP51448 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RoraP51448 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RoraP51448 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RoraP51448 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RoraP51448 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RoraP51448 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RoraP51448 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RoraP51448 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RoraP51448 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RoraP51448 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RoraP51448 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RoraP51448 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RoraP51448 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RoraP51448 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RoraP51448 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RoraP51448 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RoraP51448 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RoraP51448 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RoraP51448 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RoraP51448 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RoraP51448 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RoraP51448 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RoraP51448 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RoraP51448 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RoraP51448 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RoraP51448 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RoraP51448 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RoraP51448 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RoraP51448 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RoraP51448 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RoraP51448 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RoraP51448 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RoraP51448 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RoraP51448 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RoraP51448 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RoraP51448 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RoraP51448 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RoraP51448 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RoraP51448 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RoraP51448 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RoraP51448 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RoraP51448 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RoraP51448 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RoraP51448 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RoraP51448 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RoraP51448 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RoraP51448 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RoraP51448 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RoraP51448 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RoraP51448 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RoraP51448 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RoraP51448 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
RoraP51448 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RoraP51448 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RoraP51448 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RoraP51448 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RoraP51448 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RoraP51448 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RoraP51448 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RoraP51448 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RoraP51448 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RoraP51448 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RoraP51448 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RoraP51448 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RoraP51448 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RoraP51448 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RoraP51448 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RoraP51448 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RoraP51448 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RoraP51448 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RoraP51448 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RoraP51448 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RoraP51448 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RoraP51448 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RoraP51448 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RoraP51448 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RoraP51448 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RoraP51448 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RoraP51448 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RoraP51448 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RoraP51448 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms