Protein–RNA interactions for Protein: P49582

Chrna7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna7P49582 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrna7P49582 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms