Protein–RNA interactions for Protein: P49452

Cenpc, Centromere protein C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpcP49452 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CenpcP49452 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CenpcP49452 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CenpcP49452 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CenpcP49452 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CenpcP49452 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CenpcP49452 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CenpcP49452 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CenpcP49452 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CenpcP49452 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CenpcP49452 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CenpcP49452 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CenpcP49452 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CenpcP49452 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CenpcP49452 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CenpcP49452 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CenpcP49452 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CenpcP49452 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms