Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tnni3P48787 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnni3P48787 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnni3P48787 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms