Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms