Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx1P48377 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfx1P48377 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms