Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl13P47963 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpl13P47963 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpl13P47963 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpl13P47963 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl13P47963 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl13P47963 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl13P47963 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl13P47963 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl13P47963 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl13P47963 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rpl13P47963 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl13P47963 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl13P47963 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl13P47963 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl13P47963 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rpl13P47963 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl13P47963 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl13P47963 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl13P47963 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl13P47963 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl13P47963 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl13P47963 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl13P47963 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl13P47963 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl13P47963 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl13P47963 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl13P47963 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl13P47963 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl13P47963 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl13P47963 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl13P47963 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl13P47963 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl13P47963 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl13P47963 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl13P47963 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl13P47963 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl13P47963 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl13P47963 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl13P47963 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl13P47963 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl13P47963 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl13P47963 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl13P47963 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl13P47963 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rpl13P47963 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl13P47963 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl13P47963 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl13P47963 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl13P47963 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl13P47963 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl13P47963 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl13P47963 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl13P47963 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl13P47963 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl13P47963 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl13P47963 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rpl13P47963 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl13P47963 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl13P47963 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl13P47963 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms