Protein–RNA interactions for Protein: P43276

Hist1h1b, Histone H1.5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h1bP43276 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms