Protein–RNA interactions for Protein: P43135

Nr2f2, COUP transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f2P43135 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr2f2P43135 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nr2f2P43135 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2f2P43135 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2f2P43135 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nr2f2P43135 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2f2P43135 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2f2P43135 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2f2P43135 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.2 ms