Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NodalP43021 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NodalP43021 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NodalP43021 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NodalP43021 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NodalP43021 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NodalP43021 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NodalP43021 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NodalP43021 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NodalP43021 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NodalP43021 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NodalP43021 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NodalP43021 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NodalP43021 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NodalP43021 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NodalP43021 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NodalP43021 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NodalP43021 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NodalP43021 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NodalP43021 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NodalP43021 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NodalP43021 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NodalP43021 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NodalP43021 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NodalP43021 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NodalP43021 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NodalP43021 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NodalP43021 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NodalP43021 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NodalP43021 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NodalP43021 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NodalP43021 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NodalP43021 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NodalP43021 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NodalP43021 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NodalP43021 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NodalP43021 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NodalP43021 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NodalP43021 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NodalP43021 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NodalP43021 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NodalP43021 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NodalP43021 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NodalP43021 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NodalP43021 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NodalP43021 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NodalP43021 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NodalP43021 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NodalP43021 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NodalP43021 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NodalP43021 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NodalP43021 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NodalP43021 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NodalP43021 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NodalP43021 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NodalP43021 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NodalP43021 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NodalP43021 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NodalP43021 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NodalP43021 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NodalP43021 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NodalP43021 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NodalP43021 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NodalP43021 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NodalP43021 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NodalP43021 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NodalP43021 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NodalP43021 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NodalP43021 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NodalP43021 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NodalP43021 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NodalP43021 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NodalP43021 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NodalP43021 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NodalP43021 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NodalP43021 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NodalP43021 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NodalP43021 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NodalP43021 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NodalP43021 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NodalP43021 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NodalP43021 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NodalP43021 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NodalP43021 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NodalP43021 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NodalP43021 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NodalP43021 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NodalP43021 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NodalP43021 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NodalP43021 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NodalP43021 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NodalP43021 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NodalP43021 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NodalP43021 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NodalP43021 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NodalP43021 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NodalP43021 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NodalP43021 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NodalP43021 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NodalP43021 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms