Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Etv1P41164 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Etv1P41164 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Etv1P41164 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Etv1P41164 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Etv1P41164 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Etv1P41164 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms