Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc5P35689 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc5P35689 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc5P35689 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc5P35689 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc5P35689 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc5P35689 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc5P35689 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc5P35689 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ercc5P35689 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ercc5P35689 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ercc5P35689 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ercc5P35689 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ercc5P35689 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ercc5P35689 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ercc5P35689 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ercc5P35689 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ercc5P35689 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ercc5P35689 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ercc5P35689 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ercc5P35689 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ercc5P35689 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ercc5P35689 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ercc5P35689 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ercc5P35689 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ercc5P35689 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc5P35689 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc5P35689 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc5P35689 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc5P35689 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ercc5P35689 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc5P35689 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc5P35689 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc5P35689 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc5P35689 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc5P35689 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc5P35689 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc5P35689 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc5P35689 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc5P35689 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc5P35689 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc5P35689 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ercc5P35689 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc5P35689 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc5P35689 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc5P35689 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc5P35689 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc5P35689 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ercc5P35689 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc5P35689 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc5P35689 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc5P35689 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc5P35689 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc5P35689 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc5P35689 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc5P35689 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc5P35689 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc5P35689 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc5P35689 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc5P35689 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ercc5P35689 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ercc5P35689 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ercc5P35689 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ercc5P35689 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ercc5P35689 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ercc5P35689 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ercc5P35689 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms