Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rfc1P35601 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfc1P35601 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms