Protein–RNA interactions for Protein: P35428

Hes1, Transcription factor HES-1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes1P35428 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hes1P35428 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hes1P35428 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes1P35428 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes1P35428 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes1P35428 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes1P35428 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes1P35428 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms