Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab20P35295 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab20P35295 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab20P35295 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab20P35295 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab20P35295 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab20P35295 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab20P35295 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms