Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3dP35276 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms