Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn11P35235 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms