Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mmp12P34960 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms