Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ifnar1P33896 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms