Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms