Protein–RNA interactions for Protein: P32115

Pax4, Paired box protein Pax-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax4P32115 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax4P32115 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax4P32115 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax4P32115 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax4P32115 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax4P32115 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax4P32115 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax4P32115 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax4P32115 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax4P32115 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax4P32115 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax4P32115 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax4P32115 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax4P32115 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pax4P32115 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pax4P32115 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pax4P32115 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax4P32115 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax4P32115 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax4P32115 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax4P32115 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax4P32115 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax4P32115 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax4P32115 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax4P32115 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax4P32115 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax4P32115 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax4P32115 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax4P32115 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax4P32115 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pax4P32115 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms